6. 嵌套网络

Cytoscape 具有将嵌套网络（Nested Network）与任何节点相关联的功能。嵌套网络可以是 Cytoscape 中当前定义的任何其他网络。此功能允许创建网络层次结构以及循环关系。例如，各种模块查找插件会利用它们生成的概览网络中的嵌套网络。在概览网络中，每个代表模块的节点都包含一个嵌套网络。

请注意，嵌套网络在概念上与 组（Groups） 相似，但其产生的后果大不相同。嵌套网络包含一个独立的网络，该网络不与当前网络共享节点或属性——它只能作为单独的网络集合或在单独的 Cytoscape 会话中进行编辑。其节点不能连接到当前网络中的节点，也无法使用 Cytoscape 函数或应用程序进行查找或筛选。相反，组中的节点是当前网络的一部分，可以与组外的节点建立边，并且可以使用 Cytoscape 函数或应用程序进行查找或筛选。

大多数情况下，组 功能更强大且更易于使用。

6.1. 创建嵌套网络

嵌套网络是通过手动构建网络，并利用右键点击节点的上下文菜单将嵌套网络分配给各个节点来创建的。（参见 嵌套网络节点上下文菜单）。

6.2. 嵌套网络的可视化

当包含嵌套网络的节点被充分放大时，会显示嵌套网络的图像。如果嵌套网络当前不存在网络视图，则图像将显示为默认图标；否则，它将显示为嵌套网络当前布局的低分辨率渲染图。